首先在生产成本上，二维码与一维条码一样，几乎是零成本的信息存储技术。二维码主要是通过将信息通过一定的算法转化成计算机容易识别的图形，将这样的图形在打印到物品上，因为打印或印刷一个图形的成本仅仅在于制作二维码标签本身的价值，所以成本接近零。而RFID技术在推广和使用上的瓶颈源于它的成本较高。RFID电子标签每个的成本都要在1美元以上，对于一般的小成本商品而言，RFID电子标签的价格要高于商品本身价格很多，因此一般的厂商或销售商都难以承受。
二维码在移动电子商务中应经有较好的应用。以目前比较火的电子商务交易平台——淘宝为例。
为了提高店铺在淘宝平台上的竞争力，很多商家都制作了自己的店铺二维码，买家可以通过手机扫描二维码进入店铺的网站，了解店铺的信用，商品信息，领取店家的折扣券等等。这种成本低、效率高的促销手段很受买家的欢迎，也增加了店铺的销售额。而且商家可以制作产品二维码，附于产品包装上，消费者扫描产品包装上的二维码，随时进入商家的线上店铺网站，在线上商城进行购物。在移动电子商务中的应用，二维码具有绝对优势，是不能被RFID标签所取代的。
从安全性的角度来看。RFID技术会不定时的发出射频信号，我们可以通过读写器读取RFID标签的位置，这不利于隐私的保护。而二维码有加密技术支持，可以限制扫码查看权限、更改内容权限等，更具安全性和防伪性。
